Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkceP16054 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkceP16054 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkceP16054 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrkceP16054 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkceP16054 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkceP16054 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkceP16054 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkceP16054 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkceP16054 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkceP16054 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms