Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf1P15314 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf1P15314 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf1P15314 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf1P15314 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf1P15314 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf1P15314 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf1P15314 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf1P15314 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf1P15314 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms