Protein–RNA interactions for Protein: P13412

Tnni2, Troponin I, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni2P13412 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnni2P13412 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnni2P13412 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms