Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb1P13372 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms