Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OtcP11725 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OtcP11725 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OtcP11725 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OtcP11725 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OtcP11725 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OtcP11725 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OtcP11725 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OtcP11725 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OtcP11725 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OtcP11725 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OtcP11725 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OtcP11725 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OtcP11725 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OtcP11725 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OtcP11725 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OtcP11725 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OtcP11725 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OtcP11725 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OtcP11725 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OtcP11725 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OtcP11725 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
OtcP11725 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OtcP11725 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OtcP11725 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OtcP11725 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OtcP11725 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OtcP11725 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OtcP11725 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OtcP11725 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OtcP11725 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtcP11725 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtcP11725 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OtcP11725 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtcP11725 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtcP11725 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtcP11725 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtcP11725 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtcP11725 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtcP11725 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtcP11725 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtcP11725 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtcP11725 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtcP11725 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OtcP11725 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OtcP11725 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtcP11725 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtcP11725 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtcP11725 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtcP11725 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtcP11725 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtcP11725 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtcP11725 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtcP11725 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtcP11725 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtcP11725 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtcP11725 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtcP11725 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtcP11725 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtcP11725 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtcP11725 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OtcP11725 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtcP11725 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtcP11725 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtcP11725 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtcP11725 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtcP11725 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OtcP11725 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtcP11725 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtcP11725 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtcP11725 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtcP11725 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtcP11725 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtcP11725 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OtcP11725 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtcP11725 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtcP11725 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtcP11725 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtcP11725 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtcP11725 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OtcP11725 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtcP11725 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtcP11725 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtcP11725 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtcP11725 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtcP11725 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtcP11725 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtcP11725 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtcP11725 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
OtcP11725 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtcP11725 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtcP11725 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtcP11725 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtcP11725 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OtcP11725 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtcP11725 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtcP11725 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtcP11725 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtcP11725 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OtcP11725 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms