Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt8P11679 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt8P11679 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt8P11679 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt8P11679 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt8P11679 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt8P11679 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt8P11679 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt8P11679 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt8P11679 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt8P11679 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt8P11679 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt8P11679 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt8P11679 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt8P11679 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt8P11679 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt8P11679 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt8P11679 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt8P11679 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt8P11679 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt8P11679 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt8P11679 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt8P11679 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt8P11679 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt8P11679 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt8P11679 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt8P11679 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt8P11679 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt8P11679 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt8P11679 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt8P11679 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt8P11679 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms