Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DmdP11531 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DmdP11531 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DmdP11531 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DmdP11531 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DmdP11531 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DmdP11531 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DmdP11531 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DmdP11531 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DmdP11531 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DmdP11531 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DmdP11531 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DmdP11531 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DmdP11531 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DmdP11531 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DmdP11531 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DmdP11531 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DmdP11531 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DmdP11531 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DmdP11531 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DmdP11531 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DmdP11531 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DmdP11531 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DmdP11531 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DmdP11531 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DmdP11531 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DmdP11531 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DmdP11531 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
DmdP11531 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DmdP11531 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DmdP11531 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DmdP11531 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DmdP11531 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DmdP11531 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DmdP11531 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DmdP11531 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DmdP11531 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DmdP11531 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DmdP11531 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
DmdP11531 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DmdP11531 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DmdP11531 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DmdP11531 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DmdP11531 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
DmdP11531 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DmdP11531 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DmdP11531 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
DmdP11531 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DmdP11531 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DmdP11531 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DmdP11531 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DmdP11531 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DmdP11531 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DmdP11531 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DmdP11531 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DmdP11531 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DmdP11531 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DmdP11531 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DmdP11531 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DmdP11531 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DmdP11531 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DmdP11531 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
DmdP11531 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DmdP11531 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DmdP11531 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DmdP11531 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
DmdP11531 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DmdP11531 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DmdP11531 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DmdP11531 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DmdP11531 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
DmdP11531 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
DmdP11531 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DmdP11531 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DmdP11531 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DmdP11531 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DmdP11531 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DmdP11531 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DmdP11531 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
DmdP11531 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DmdP11531 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DmdP11531 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DmdP11531 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
DmdP11531 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
DmdP11531 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DmdP11531 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DmdP11531 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DmdP11531 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DmdP11531 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DmdP11531 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
DmdP11531 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DmdP11531 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
DmdP11531 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DmdP11531 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DmdP11531 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DmdP11531 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DmdP11531 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DmdP11531 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
DmdP11531 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
DmdP11531 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms