Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa1P11477 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa1P11477 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa1P11477 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa1P11477 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa1P11477 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms