Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lamp1P11438 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamp1P11438 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamp1P11438 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms