Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CatspereP0DP43 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CatspereP0DP43 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CatspereP0DP43 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms