Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PtprqP0C5E4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PtprqP0C5E4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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PtprqP0C5E4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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PtprqP0C5E4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PtprqP0C5E4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PtprqP0C5E4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PtprqP0C5E4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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PtprqP0C5E4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PtprqP0C5E4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PtprqP0C5E4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PtprqP0C5E4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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PtprqP0C5E4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PtprqP0C5E4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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PtprqP0C5E4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprqP0C5E4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprqP0C5E4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprqP0C5E4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprqP0C5E4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprqP0C5E4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprqP0C5E4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtprqP0C5E4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprqP0C5E4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprqP0C5E4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprqP0C5E4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprqP0C5E4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprqP0C5E4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprqP0C5E4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprqP0C5E4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprqP0C5E4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprqP0C5E4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprqP0C5E4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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