Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LtaP09225 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LtaP09225 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtaP09225 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtaP09225 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtaP09225 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtaP09225 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtaP09225 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtaP09225 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtaP09225 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtaP09225 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LtaP09225 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtaP09225 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtaP09225 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtaP09225 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtaP09225 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtaP09225 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtaP09225 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtaP09225 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtaP09225 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtaP09225 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtaP09225 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtaP09225 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtaP09225 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtaP09225 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtaP09225 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LtaP09225 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtaP09225 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtaP09225 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LtaP09225 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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LtaP09225 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtaP09225 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtaP09225 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LtaP09225 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtaP09225 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtaP09225 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LtaP09225 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LtaP09225 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtaP09225 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtaP09225 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtaP09225 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtaP09225 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LtaP09225 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtaP09225 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtaP09225 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtaP09225 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LtaP09225 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtaP09225 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtaP09225 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtaP09225 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtaP09225 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtaP09225 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtaP09225 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtaP09225 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtaP09225 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtaP09225 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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LtaP09225 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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LtaP09225 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtaP09225 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LtaP09225 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtaP09225 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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LtaP09225 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtaP09225 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtaP09225 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtaP09225 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtaP09225 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtaP09225 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LtaP09225 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtaP09225 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtaP09225 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtaP09225 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtaP09225 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtaP09225 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtaP09225 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtaP09225 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LtaP09225 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtaP09225 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LtaP09225 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LtaP09225 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LtaP09225 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtaP09225 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtaP09225 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtaP09225 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtaP09225 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtaP09225 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LtaP09225 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LtaP09225 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LtaP09225 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtaP09225 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtaP09225 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtaP09225 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LtaP09225 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms