Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NefmP08553 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NefmP08553 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NefmP08553 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NefmP08553 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NefmP08553 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NefmP08553 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NefmP08553 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NefmP08553 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NefmP08553 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NefmP08553 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NefmP08553 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NefmP08553 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NefmP08553 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NefmP08553 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NefmP08553 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NefmP08553 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NefmP08553 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NefmP08553 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NefmP08553 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NefmP08553 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NefmP08553 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NefmP08553 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NefmP08553 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NefmP08553 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NefmP08553 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NefmP08553 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NefmP08553 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NefmP08553 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NefmP08553 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NefmP08553 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NefmP08553 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NefmP08553 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NefmP08553 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NefmP08553 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NefmP08553 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NefmP08553 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NefmP08553 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NefmP08553 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NefmP08553 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NefmP08553 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NefmP08553 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NefmP08553 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NefmP08553 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NefmP08553 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NefmP08553 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NefmP08553 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NefmP08553 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NefmP08553 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NefmP08553 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NefmP08553 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NefmP08553 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NefmP08553 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NefmP08553 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NefmP08553 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NefmP08553 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NefmP08553 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NefmP08553 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NefmP08553 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NefmP08553 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NefmP08553 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NefmP08553 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NefmP08553 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NefmP08553 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NefmP08553 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NefmP08553 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NefmP08553 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NefmP08553 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NefmP08553 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NefmP08553 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NefmP08553 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NefmP08553 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NefmP08553 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NefmP08553 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NefmP08553 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NefmP08553 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NefmP08553 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NefmP08553 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NefmP08553 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NefmP08553 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NefmP08553 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NefmP08553 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NefmP08553 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NefmP08553 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NefmP08553 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NefmP08553 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NefmP08553 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NefmP08553 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NefmP08553 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NefmP08553 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NefmP08553 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NefmP08553 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NefmP08553 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NefmP08553 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NefmP08553 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NefmP08553 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NefmP08553 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NefmP08553 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NefmP08553 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NefmP08553 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms