Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spta1P08032 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spta1P08032 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spta1P08032 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spta1P08032 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spta1P08032 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spta1P08032 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spta1P08032 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spta1P08032 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spta1P08032 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms