Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtrP07309 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtrP07309 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtrP07309 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtrP07309 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtrP07309 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtrP07309 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtrP07309 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtrP07309 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtrP07309 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtrP07309 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtrP07309 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtrP07309 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtrP07309 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtrP07309 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtrP07309 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtrP07309 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtrP07309 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TtrP07309 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtrP07309 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtrP07309 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtrP07309 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtrP07309 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtrP07309 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TtrP07309 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtrP07309 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtrP07309 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtrP07309 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtrP07309 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtrP07309 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtrP07309 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtrP07309 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtrP07309 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtrP07309 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtrP07309 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TtrP07309 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtrP07309 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtrP07309 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtrP07309 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtrP07309 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtrP07309 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtrP07309 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtrP07309 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtrP07309 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtrP07309 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtrP07309 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TtrP07309 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtrP07309 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtrP07309 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtrP07309 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtrP07309 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtrP07309 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtrP07309 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtrP07309 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtrP07309 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtrP07309 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtrP07309 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtrP07309 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtrP07309 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtrP07309 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TtrP07309 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TtrP07309 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtrP07309 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtrP07309 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtrP07309 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtrP07309 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtrP07309 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtrP07309 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtrP07309 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtrP07309 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtrP07309 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtrP07309 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtrP07309 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TtrP07309 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtrP07309 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtrP07309 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtrP07309 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtrP07309 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtrP07309 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtrP07309 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtrP07309 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtrP07309 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtrP07309 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtrP07309 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtrP07309 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtrP07309 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtrP07309 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TtrP07309 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TtrP07309 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TtrP07309 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TtrP07309 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TtrP07309 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TtrP07309 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TtrP07309 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TtrP07309 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TtrP07309 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TtrP07309 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TtrP07309 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtrP07309 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TtrP07309 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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