Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Me1P06801 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Me1P06801 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Me1P06801 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Me1P06801 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Me1P06801 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Me1P06801 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Me1P06801 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Me1P06801 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Me1P06801 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Me1P06801 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Me1P06801 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Me1P06801 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Me1P06801 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Me1P06801 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Me1P06801 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Me1P06801 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Me1P06801 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Me1P06801 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Me1P06801 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Me1P06801 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Me1P06801 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Me1P06801 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Me1P06801 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Me1P06801 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Me1P06801 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Me1P06801 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Me1P06801 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Me1P06801 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Me1P06801 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Me1P06801 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Me1P06801 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Me1P06801 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Me1P06801 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Me1P06801 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Me1P06801 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Me1P06801 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Me1P06801 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Me1P06801 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Me1P06801 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Me1P06801 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Me1P06801 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Me1P06801 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Me1P06801 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Me1P06801 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Me1P06801 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Me1P06801 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Me1P06801 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Me1P06801 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Me1P06801 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Me1P06801 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Me1P06801 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Me1P06801 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Me1P06801 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Me1P06801 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Me1P06801 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Me1P06801 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Me1P06801 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Me1P06801 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Me1P06801 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Me1P06801 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Me1P06801 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Me1P06801 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Me1P06801 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Me1P06801 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Me1P06801 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Me1P06801 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Me1P06801 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Me1P06801 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Me1P06801 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Me1P06801 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Me1P06801 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Me1P06801 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Me1P06801 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Me1P06801 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Me1P06801 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Me1P06801 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Me1P06801 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Me1P06801 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Me1P06801 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Me1P06801 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Me1P06801 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Me1P06801 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Me1P06801 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Me1P06801 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Me1P06801 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Me1P06801 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Me1P06801 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Me1P06801 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Me1P06801 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Me1P06801 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Me1P06801 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Me1P06801 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Me1P06801 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Me1P06801 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Me1P06801 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Me1P06801 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Me1P06801 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Me1P06801 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Me1P06801 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms