Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprcP06800 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprcP06800 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprcP06800 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprcP06800 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprcP06800 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprcP06800 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PtprcP06800 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprcP06800 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprcP06800 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprcP06800 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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PtprcP06800 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprcP06800 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprcP06800 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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PtprcP06800 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprcP06800 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PtprcP06800 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PtprcP06800 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PtprcP06800 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprcP06800 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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PtprcP06800 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprcP06800 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprcP06800 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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PtprcP06800 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PtprcP06800 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprcP06800 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprcP06800 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprcP06800 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprcP06800 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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PtprcP06800 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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PtprcP06800 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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PtprcP06800 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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PtprcP06800 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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PtprcP06800 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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PtprcP06800 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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PtprcP06800 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprcP06800 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprcP06800 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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