Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoa4P06728 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apoa4P06728 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms