Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06321 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06321 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06321 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06321 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06321 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06321 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06321 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06321 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06321 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06321 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06321 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06321 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06321 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06321 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06321 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06321 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P06321 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06321 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
P06321 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06321 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06321 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06321 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06321 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06321 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06321 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06321 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06321 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
P06321 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06321 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06321 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06321 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06321 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P06321 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06321 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06321 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06321 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06321 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06321 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06321 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06321 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06321 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06321 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P06321 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06321 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06321 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06321 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06321 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06321 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06321 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06321 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06321 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06321 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P06321 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06321 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06321 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06321 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06321 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06321 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06321 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06321 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06321 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06321 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P06321 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06321 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06321 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06321 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06321 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06321 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06321 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06321 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06321 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06321 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06321 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06321 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06321 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06321 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06321 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06321 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms