Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mtnd1P03888 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtnd1P03888 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms