Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hoxa7P02830 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxa7P02830 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa7P02830 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms