Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01915 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01915 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01915 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01915 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01915 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01915 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01915 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01915 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01915 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01915 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01915 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01915 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01915 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01915 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01915 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01915 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01915 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01915 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01915 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01915 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01915 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01915 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01915 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01915 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01915 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01915 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01915 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01915 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01915 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01915 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01915 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01915 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01915 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01915 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01915 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01915 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01915 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01915 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01915 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01915 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01915 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01915 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01915 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01915 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01915 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01915 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01915 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01915 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01915 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01915 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01915 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01915 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01915 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01915 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01915 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01915 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01915 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01915 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01915 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01915 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01915 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01915 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01915 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01915 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01915 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01915 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01915 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01915 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01915 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01915 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01915 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01915 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01915 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01915 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01915 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01915 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01915 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01915 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01915 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01915 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01915 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01915 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01915 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01915 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01915 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01915 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01915 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01915 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01915 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01915 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01915 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01915 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01915 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01915 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01915 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01915 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01915 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01915 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01915 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.3 ms