Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-AaP01910 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-AaP01910 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.1 ms