Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01787 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01787 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01787 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01787 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01787 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01787 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01787 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01787 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01787 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01787 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01787 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01787 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01787 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01787 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01787 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01787 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01787 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01787 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01787 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01787 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01787 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01787 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01787 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01787 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01787 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01787 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01787 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01787 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01787 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01787 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01787 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01787 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01787 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01787 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01787 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01787 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01787 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01787 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01787 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01787 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01787 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01787 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01787 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01787 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01787 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01787 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01787 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01787 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01787 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01787 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01787 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01787 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01787 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01787 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01787 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01787 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01787 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01787 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01787 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01787 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01787 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01787 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01787 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01787 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01787 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01787 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01787 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01787 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01787 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01787 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01787 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01787 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01787 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01787 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01787 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01787 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01787 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01787 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01787 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01787 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01787 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01787 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01787 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01787 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01787 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01787 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01787 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01787 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01787 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01787 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01787 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01787 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01787 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01787 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01787 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01787 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01787 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01787 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01787 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms