Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01739 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01739 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01739 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01739 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01739 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01739 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01739 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01739 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01739 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01739 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01739 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01739 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01739 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01739 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01739 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01739 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01739 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01739 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01739 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01739 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01739 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01739 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01739 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01739 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01739 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01739 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01739 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01739 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01739 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01739 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01739 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01739 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01739 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01739 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01739 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01739 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01739 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01739 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01739 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01739 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01739 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01739 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01739 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01739 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01739 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01739 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01739 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01739 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01739 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01739 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01739 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01739 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01739 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01739 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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P01739 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01739 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01739 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01739 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01739 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01739 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01739 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01739 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01739 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01739 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01739 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01739 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01739 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01739 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01739 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01739 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01739 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01739 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01739 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01739 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01739 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01739 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01739 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01739 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01739 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01739 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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