Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01738 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01738 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01738 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01738 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01738 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01738 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01738 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01738 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01738 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01738 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01738 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01738 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01738 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01738 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01738 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01738 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01738 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01738 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01738 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01738 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01738 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01738 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01738 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01738 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01738 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01738 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01738 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01738 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01738 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01738 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01738 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01738 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01738 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01738 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01738 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01738 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01738 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01738 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01738 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01738 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01738 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01738 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01738 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01738 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01738 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01738 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01738 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01738 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01738 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01738 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01738 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01738 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01738 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01738 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P01738 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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