Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01727 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01727 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01727 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01727 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01727 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01727 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01727 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01727 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01727 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01727 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01727 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01727 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01727 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01727 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01727 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01727 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01727 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01727 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01727 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01727 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01727 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01727 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01727 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01727 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01727 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01727 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01727 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01727 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01727 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01727 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01727 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01727 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01727 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01727 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01727 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01727 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01727 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01727 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01727 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01727 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01727 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01727 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01727 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01727 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01727 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01727 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01727 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01727 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01727 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01727 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01727 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01727 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01727 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01727 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01727 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01727 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01727 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01727 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01727 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01727 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01727 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01727 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01727 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01727 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01727 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01727 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01727 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01727 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01727 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01727 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01727 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01727 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01727 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01727 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P01727 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01727 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01727 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01727 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms