Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna1P01572 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna1P01572 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna1P01572 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna1P01572 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna1P01572 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna1P01572 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna1P01572 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna1P01572 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna1P01572 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna1P01572 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna1P01572 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna1P01572 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna1P01572 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna1P01572 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna1P01572 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna1P01572 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna1P01572 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna1P01572 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms