Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Odc1P00860 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Odc1P00860 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Odc1P00860 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Odc1P00860 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odc1P00860 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odc1P00860 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Odc1P00860 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Odc1P00860 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Odc1P00860 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Odc1P00860 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odc1P00860 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms