Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abl1P00520 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abl1P00520 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abl1P00520 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abl1P00520 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abl1P00520 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abl1P00520 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Abl1P00520 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abl1P00520 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abl1P00520 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms