Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vti1aO89116 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vti1aO89116 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vti1aO89116 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vti1aO89116 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vti1aO89116 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vti1aO89116 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vti1aO89116 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vti1aO89116 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vti1aO89116 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vti1aO89116 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vti1aO89116 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vti1aO89116 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vti1aO89116 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vti1aO89116 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms