Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccl20O89093 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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