Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Robo1O89026 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Robo1O89026 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Robo1O89026 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Robo1O89026 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Robo1O89026 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Robo1O89026 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Robo1O89026 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Robo1O89026 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Robo1O89026 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Robo1O89026 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Robo1O89026 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Robo1O89026 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Robo1O89026 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Robo1O89026 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Robo1O89026 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Robo1O89026 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Robo1O89026 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Robo1O89026 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Robo1O89026 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Robo1O89026 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Robo1O89026 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Robo1O89026 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Robo1O89026 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Robo1O89026 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Robo1O89026 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Robo1O89026 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Robo1O89026 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Robo1O89026 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Robo1O89026 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Robo1O89026 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Robo1O89026 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Robo1O89026 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms