Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Setdb1O88974 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Setdb1O88974 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms