Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tcn2O88968 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcn2O88968 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcn2O88968 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms