Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MscO88940 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MscO88940 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MscO88940 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MscO88940 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MscO88940 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MscO88940 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MscO88940 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MscO88940 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MscO88940 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MscO88940 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MscO88940 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MscO88940 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MscO88940 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MscO88940 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MscO88940 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MscO88940 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MscO88940 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MscO88940 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MscO88940 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MscO88940 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MscO88940 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MscO88940 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MscO88940 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MscO88940 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MscO88940 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MscO88940 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MscO88940 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MscO88940 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MscO88940 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MscO88940 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MscO88940 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MscO88940 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MscO88940 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MscO88940 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MscO88940 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MscO88940 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MscO88940 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MscO88940 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MscO88940 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MscO88940 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MscO88940 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MscO88940 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MscO88940 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MscO88940 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MscO88940 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MscO88940 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MscO88940 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MscO88940 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MscO88940 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MscO88940 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MscO88940 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MscO88940 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MscO88940 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MscO88940 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MscO88940 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MscO88940 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MscO88940 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MscO88940 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MscO88940 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MscO88940 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MscO88940 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MscO88940 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MscO88940 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MscO88940 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MscO88940 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MscO88940 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MscO88940 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MscO88940 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MscO88940 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MscO88940 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MscO88940 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MscO88940 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MscO88940 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MscO88940 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MscO88940 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MscO88940 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MscO88940 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MscO88940 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MscO88940 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MscO88940 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MscO88940 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MscO88940 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MscO88940 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MscO88940 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MscO88940 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MscO88940 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MscO88940 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MscO88940 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MscO88940 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MscO88940 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MscO88940 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MscO88940 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MscO88940 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MscO88940 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MscO88940 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MscO88940 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MscO88940 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MscO88940 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MscO88940 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms