Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
JtbO88824 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
JtbO88824 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JtbO88824 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JtbO88824 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
JtbO88824 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
JtbO88824 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
JtbO88824 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JtbO88824 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JtbO88824 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JtbO88824 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JtbO88824 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JtbO88824 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JtbO88824 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
JtbO88824 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JtbO88824 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JtbO88824 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JtbO88824 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JtbO88824 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JtbO88824 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JtbO88824 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
JtbO88824 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JtbO88824 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
JtbO88824 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
JtbO88824 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JtbO88824 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
JtbO88824 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
JtbO88824 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
JtbO88824 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JtbO88824 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JtbO88824 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JtbO88824 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JtbO88824 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JtbO88824 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JtbO88824 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JtbO88824 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JtbO88824 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
JtbO88824 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JtbO88824 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JtbO88824 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JtbO88824 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JtbO88824 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JtbO88824 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JtbO88824 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JtbO88824 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JtbO88824 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
JtbO88824 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
JtbO88824 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JtbO88824 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JtbO88824 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JtbO88824 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JtbO88824 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
JtbO88824 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JtbO88824 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
JtbO88824 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JtbO88824 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JtbO88824 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JtbO88824 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JtbO88824 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JtbO88824 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JtbO88824 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JtbO88824 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JtbO88824 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JtbO88824 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JtbO88824 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
JtbO88824 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JtbO88824 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JtbO88824 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JtbO88824 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JtbO88824 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JtbO88824 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
JtbO88824 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
JtbO88824 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
JtbO88824 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
JtbO88824 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
JtbO88824 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
JtbO88824 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
JtbO88824 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JtbO88824 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
JtbO88824 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JtbO88824 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
JtbO88824 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JtbO88824 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JtbO88824 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JtbO88824 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JtbO88824 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JtbO88824 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JtbO88824 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
JtbO88824 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
JtbO88824 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
JtbO88824 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JtbO88824 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
JtbO88824 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JtbO88824 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JtbO88824 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JtbO88824 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
JtbO88824 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JtbO88824 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
JtbO88824 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
JtbO88824 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms