Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
BlmO88700 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BlmO88700 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BlmO88700 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BlmO88700 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
BlmO88700 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
BlmO88700 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
BlmO88700 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BlmO88700 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BlmO88700 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BlmO88700 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
BlmO88700 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
BlmO88700 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BlmO88700 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
BlmO88700 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
BlmO88700 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BlmO88700 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BlmO88700 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BlmO88700 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BlmO88700 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BlmO88700 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BlmO88700 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
BlmO88700 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
BlmO88700 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
BlmO88700 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
BlmO88700 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
BlmO88700 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BlmO88700 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BlmO88700 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BlmO88700 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
BlmO88700 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BlmO88700 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
BlmO88700 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
BlmO88700 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
BlmO88700 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
BlmO88700 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
BlmO88700 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BlmO88700 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BlmO88700 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BlmO88700 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BlmO88700 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BlmO88700 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BlmO88700 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BlmO88700 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
BlmO88700 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
BlmO88700 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
BlmO88700 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
BlmO88700 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
BlmO88700 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BlmO88700 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BlmO88700 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BlmO88700 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BlmO88700 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BlmO88700 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
BlmO88700 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
BlmO88700 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BlmO88700 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BlmO88700 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BlmO88700 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BlmO88700 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
BlmO88700 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
BlmO88700 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BlmO88700 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BlmO88700 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
BlmO88700 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BlmO88700 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BlmO88700 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BlmO88700 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BlmO88700 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BlmO88700 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
BlmO88700 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
BlmO88700 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BlmO88700 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BlmO88700 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BlmO88700 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BlmO88700 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BlmO88700 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
BlmO88700 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BlmO88700 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
BlmO88700 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BlmO88700 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BlmO88700 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BlmO88700 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BlmO88700 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
BlmO88700 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BlmO88700 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
BlmO88700 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BlmO88700 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BlmO88700 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BlmO88700 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BlmO88700 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BlmO88700 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
BlmO88700 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
BlmO88700 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
BlmO88700 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BlmO88700 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
BlmO88700 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BlmO88700 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BlmO88700 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BlmO88700 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms