Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3fO88632 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms