Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc27a3O88561 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Slc27a3O88561 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc27a3O88561 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc27a3O88561 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc27a3O88561 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc27a3O88561 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc27a3O88561 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc27a3O88561 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc27a3O88561 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc27a3O88561 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc27a3O88561 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc27a3O88561 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc27a3O88561 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc27a3O88561 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc27a3O88561 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms