Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cops6O88545 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cops6O88545 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cops6O88545 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops6O88545 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cops6O88545 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cops6O88545 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cops6O88545 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops6O88545 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cops6O88545 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cops6O88545 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms