Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cops3O88543 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cops3O88543 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cops3O88543 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cops3O88543 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cops3O88543 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cops3O88543 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cops3O88543 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cops3O88543 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cops3O88543 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cops3O88543 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cops3O88543 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cops3O88543 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cops3O88543 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cops3O88543 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cops3O88543 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cops3O88543 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cops3O88543 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cops3O88543 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cops3O88543 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cops3O88543 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cops3O88543 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms