Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AurkcO88445 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AurkcO88445 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AurkcO88445 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AurkcO88445 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AurkcO88445 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AurkcO88445 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AurkcO88445 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AurkcO88445 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AurkcO88445 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AurkcO88445 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AurkcO88445 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AurkcO88445 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AurkcO88445 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AurkcO88445 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AurkcO88445 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AurkcO88445 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AurkcO88445 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AurkcO88445 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AurkcO88445 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AurkcO88445 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
AurkcO88445 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AurkcO88445 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AurkcO88445 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AurkcO88445 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AurkcO88445 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
AurkcO88445 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AurkcO88445 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AurkcO88445 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AurkcO88445 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AurkcO88445 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AurkcO88445 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AurkcO88445 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AurkcO88445 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AurkcO88445 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AurkcO88445 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AurkcO88445 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AurkcO88445 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AurkcO88445 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms