Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tnnt1O88346 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnnt1O88346 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnt1O88346 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms