Protein–RNA interactions for Protein: O70576

Stag3, Cohesin subunit SA-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag3O70576 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Stag3O70576 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stag3O70576 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Stag3O70576 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Stag3O70576 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Stag3O70576 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Stag3O70576 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stag3O70576 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stag3O70576 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stag3O70576 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stag3O70576 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stag3O70576 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Stag3O70576 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stag3O70576 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stag3O70576 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stag3O70576 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stag3O70576 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stag3O70576 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
Stag3O70576 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Stag3O70576 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Stag3O70576 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stag3O70576 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stag3O70576 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Stag3O70576 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Stag3O70576 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Stag3O70576 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Stag3O70576 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stag3O70576 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stag3O70576 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag3O70576 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag3O70576 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Stag3O70576 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Stag3O70576 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stag3O70576 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms