Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lnx1O70263 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lnx1O70263 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lnx1O70263 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms