Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmx1O70218 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmx1O70218 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms