Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AurkbO70126 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AurkbO70126 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AurkbO70126 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AurkbO70126 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AurkbO70126 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AurkbO70126 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AurkbO70126 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AurkbO70126 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AurkbO70126 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AurkbO70126 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
AurkbO70126 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AurkbO70126 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AurkbO70126 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AurkbO70126 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AurkbO70126 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AurkbO70126 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AurkbO70126 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AurkbO70126 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AurkbO70126 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AurkbO70126 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AurkbO70126 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AurkbO70126 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms