Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb5O55234 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms