Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChadO55226 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChadO55226 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChadO55226 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChadO55226 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChadO55226 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ChadO55226 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChadO55226 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChadO55226 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ChadO55226 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ChadO55226 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChadO55226 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChadO55226 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChadO55226 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChadO55226 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChadO55226 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChadO55226 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChadO55226 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChadO55226 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChadO55226 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChadO55226 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChadO55226 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChadO55226 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChadO55226 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChadO55226 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChadO55226 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChadO55226 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChadO55226 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChadO55226 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChadO55226 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChadO55226 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChadO55226 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChadO55226 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChadO55226 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChadO55226 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChadO55226 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChadO55226 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ChadO55226 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChadO55226 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChadO55226 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChadO55226 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChadO55226 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChadO55226 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChadO55226 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChadO55226 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChadO55226 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChadO55226 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChadO55226 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChadO55226 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ChadO55226 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChadO55226 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChadO55226 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChadO55226 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChadO55226 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChadO55226 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChadO55226 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChadO55226 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChadO55226 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChadO55226 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChadO55226 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChadO55226 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChadO55226 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChadO55226 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChadO55226 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChadO55226 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChadO55226 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChadO55226 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChadO55226 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChadO55226 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChadO55226 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChadO55226 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChadO55226 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChadO55226 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChadO55226 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChadO55226 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChadO55226 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChadO55226 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChadO55226 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChadO55226 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChadO55226 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChadO55226 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChadO55226 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChadO55226 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChadO55226 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChadO55226 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChadO55226 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChadO55226 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChadO55226 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChadO55226 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ChadO55226 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChadO55226 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChadO55226 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChadO55226 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChadO55226 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChadO55226 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChadO55226 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChadO55226 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChadO55226 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChadO55226 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChadO55226 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms